杨贤均;旷娟;全志鑫;谢金雨;肖佳伟;欧龙艳;黎颖惠;

为探究酸模叶蓼(Persicaria lapathifolia)的叶绿体基因组特征及其系统位置，本研究采用Illumina平台对酸模叶蓼的叶绿体全基因组进行测序。结果表明，酸模叶蓼叶绿体基因组由4部分组成，总长度为159 052 bp,其中，大单拷贝区(LSC)长度为83 621 bp,小单拷贝区(SSC)长度为13 149 bp, 2个反向重复区长度均为31 141 bp。基因组序列总的鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)含量为38%,共注释得到128个独特基因，包含83个蛋白质编码基因、8个rRNA基因和37个tRNA基因。酸模叶蓼叶绿体基因组相对同义密码子使用度大于1.00的密码子共有32个，其中，有29个以A/U结尾，有3个以G结尾。在酸模叶蓼叶绿体基因组中共检测209个符合条件的SSR位点，以单核苷酸重复占绝对优势，主要是A/T碱基。系统发育分析表明，酸模叶蓼与香蓼(Persicaria viscosa)的亲缘关系最近。本研究可为蓼科(Polygonaceae)叶绿体基因组及系统发育分析提供基础参考资料。

2024年03期 v.21;No.97 57-65页 [查看摘要][在线阅读][下载 484K]